Анализ вариаций аминокислотных замен и микрорнк изолятов вируса лейкоза крупного рогатого скота

Был проведен ряд исследований по изучению изолятов вируса лейкоза крупного рогатого скота на территории Новосибирской области. В рамках данных исследований изучены миссенс-мутации, SNP-замены и их влияние на тип течения инфекции. Проанализированы более 700 образцов, из них проведено полногеномное секвенирование 48 образцов. Была выявлена статистически значимая взаимосвязь между полиморфизмом A(+187)C в области последовательности активатора (DAS) в LTR (значение p = 0,00737) и высоким уровнем лимфоцитоза. Установлено, что мутация (−4)G в сайте CAP может определять тип течения инфекционного процесса при вирус-индуцированном лейкозе крупного рогатого скота. Установлено, что мутации G(-133)A/C в CRE2 (46,7 %), C(+160)T в DAS (30 %) и A(310)del в BLV-mir-B4-5p, A(357)G в BLV-mir-B4-3p, A(462)G в BLV-mir-B5-5p и GA(497-498) AG в BLV-mir-B5-3p (26,5 %) могут оказывать влияние на тип течения инфекционного процесса при вирус-индуцированном лейкозе крупного рогатого скота. Выявлено несколько полиморфизмов в геномных последовательностях BLV изолятов, которые открывают понимание механизмов реализации вирулентных свойств вируса лейкоза крупного рогатого скота.

1. Обзор эпизоотической ситуации по лейкозу крупного рогатого скота в субъектах Российской Федерации за 2008 год / М.И. Гулюкин, И.И. Барабанов, А.В. Шишкин [и др.] // Информ.-аналит. бюл. – М.: ВИЭВ, 2009. – 29 с.

2. Джупина С.И. Эпизоотический процесс лейкоза КРС и перспективы девастации возбудителя этой инфекции // Ветеринарная патология. – 2014. – № 1. – С. 98–103.

3. Влияние экологических факторов на организм животных / И.М. Донник, И.А. Шкуратова, А.Д. Шушарин [и др.] // Ветеринария. – 2007. – № 6. – C. 38–42.

4. Донник И.М., Петропавловский М.В. Региональная молекулярно-генетическая структура вируса лейкоза крупного рогатого скота // Ветеринария Кубани. – 2010. – № 3. – С. 12–13.

5. Донченко А.С., Димов С.К., Юшков Ю.Г. Эпизоотическая диагностика – научно-методическая ос нова контроля эпизоотических процессов: метод. рекомендации. – Новосибирск, 2010. – С. 31–33.

6. Дробот Е.В. Результаты изучения генотипического разнообразия вируса лейкоза крупного рогатого скота и особенности эпизоотологического и гематологического проявления: автореф. дис. … канд. биол. наук. – Новосибирск, 2007. – 18 с.

7. Смирнов П.Н., Батенёва Н.В., Белявская В.А. Генотипическое разнообразие вируса лейкоза крупного рогатого скота на территории Новосибирской области и Краснодарского края // Вестник (Новосибирский государственный аграрный университет). – 2011. – № 2 (18). – С. 81–83.

8. Смирнов П.Н. Болезнь века – лейкоз крупного рогатого скота / П.Н. Смирнов. – Новосибирск: [б. и.], 2007. – 297 с.

9. Чичинина С.В. Роль аллельной вариабельности генов цитокинов в формировании резистентности крупного рогатого скота к лейкозу: автореф. дис. … канд. биол. наук. – Новосибирск, 2005. – 24 с.

10. Use of synthetic peptides to map sequential epitopes recognized by monoclonal antibodies on the bovine leukemia virus external glycoprotein / I. Callebaut, A. Burny, V. Krchnák [et al.] // Virology. – 1991. – Vol. 185, No. 1. – DOI: 10.1016/0042-6822(91)90752-W.

11. Peripheral blood B-cell death compensates for excessive proliferation in lymphoid tissues and maintains homeostasis in bovine leukemia virus-infected sheep / C. Debacq, N. Gillet, B. Asquith [et al.] // J. Virol. – 2006. – Vol. 80. – Р. 9710–9719. – DOI: 10.1128/JVI.01022-06.

12. The complete genomic sequence of an in vivo low replicating BLV strain / S. Dube, L. Abbott, D.K. Dube [et al.] // J. Virol. – 2009. – Vol. 6. – Р. 120. – DOI: 10.1186/1743-422X-6-120.

13. Provirus variants of the bovine leukemia virus and their relation to the serological status of naturally infected cattle / H. Fechner, P. Blankenstein, A.C. Looman [et al.] // Virology. – 1997. – Vol. 237. – Р. 261–269.

14. Sequencing and phylogenetic analysis of the gp51 gene from Korean bovine leukemia virus isolates / A.J. Lee, E.J. Kim, H.K. Joung [et al.] // J. Virol. – 2015. – Vol. 12. – article 64. – DOI: 10.1186/s12985-015-0286-4.

15. Molecular epidemiological and serological studies of bovine leukemia virus (BLV) infection in Thailand cattle / E. Lee, E.J. Kim, J. Ratthanophart [et al.] // Infect Genet Evol. – 2016. – Vol. 41. – Р. 245–254. – DOI: 10.1016/j.meegid.2016.04.010.

16. Lewin H.A. Host genetic mechanism of resistance and susceptibility to a bovine retroviral infection // Anim. Biotech. – 1994. – Vol. 5. – Р. 183–191.

17. The molecular characterization of bovine leukaemia virus isolates from Eastern Europe and Siberia and its impact on phylogeny / M. Rola-Luszczak, A. Pluta, M. Olech [et al.] // PLoS One. – 2013. – Vol. 8, No. 3. – e58705. – DOI: 10.1371/journal.pone.0058705.

18. Deep sequencing reveals abundant noncanonical retroviral micrornas in b-cell leukemia/lymphoma / N. Rosewick, M. Momont, K. Durkin [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 2013. – Vol. 110. – Р. 2306– 2311. – DOI: 10.1073/pnas.1213842110.

19. Willems L. Bovine leukemia virus as a model for studying human leukemias // Bull Mem Acad R Med Belg. – 2004. – Vol. 159. – Р. 473–478.

20. Bovine leukemia virus, an animal model for the study of intrastrain variability / L. Willems, E. Thienpont, P. Kerkhofs [et al.] // J. Virol. – 1993. – Vol. 67. – Р. 1086–1089.